По всей вероятности, гаванская болонка — потомок болонок испанского и итальянского побережья Средиземноморья. Возможно, болонки попали на Кубу с испанскими переселенцами или итальянскими мореплавателями.

По другой гипотезе, эти собаки появились на Кубе из Аргентины, где их скрещивали с карликовыми пуделями. Основной окрас — «гавана» (коричневый, красновато-палевый) — породил неверное представление о том, что порода возникла в Гаване, столице Кубы.

Предков этих собак завезли на о. Реюньон французские солдаты для борьбы с грызунами. Так появились Котон-де-Реюньоны, и эта, исчезнувшая в наши дни, порода после скрещивания с мальтийской болонкой послужила основой для выведения породы на о. Мадагаскаре, названной по одной из мадагаскарских провинций Котон-де-Тулеар.

Ее использовали как норную, сторожевую и в качестве крысолова. Французские аристократы, жившие на островах в Индийском океане в колониальные времена, способствовали росту известности породы. Она была официально признана FCI в 1970г.

Полагают, что эта порода болонок родом из Средиземноморья. Известная во Франции и Испании с конца ХVI века и считающаяся французской, она, вероятнее всего, возникла путем скрещивания между мальтийскими болонками, той-спаниелями и карликовыми барбе. Некогда весьма ценившаяся аристократами, ныне эта порода редка.

Мальтез — древняя порода, о происхождении которой до сих пор ведутся горячие споры. Предки этих собачек ловили грызунов в портах и приморских городах центрального Средиземноморья.

Установлено, что эта или похожая на нее порода существовала в Древнем Египте, Древней Греции, а также в Древнем Риме. Плиний Старший сообщал, что с о. Мелита (ныне о. Млет) в Адриатике вывозят собачек под названием «canes melitenses».